5月1日，日本成田机场迎来了一批批面带口罩、全身紧裹的日本乘客，他们在防疫区不仅要严格填写健康状况报告，还要接受体温测试等检查，被排除“非典”怀疑后方可入境。从冲绳到北京学习京剧的留学生下地阳一两天前收到了日本驻北京大使馆的电子邮件劝说留学生尽快回国，他来不及选择飞往冲绳附近的飞机，就先飞到东京。
日本政府呼吁国民离开疫区
“五一”前后是在京日本留学生和企业驻华人员返回日本的高峰。从日本琦玉县到北京对外经济贸易大学学习中文的富坚利惠说4月下旬以来，学校加强了门卫制度，学生不能出去购物，有些急需的用品由教授代为买来。也有的学生说由于学校停课，已无法正常学习，只好尽快回国。据介绍，日本在北京地区的留学生有3000多人，日本大使馆4月28日通过网页和电子邮件发出回国劝告后，大部分学生很快就决定了回国。也有回国者指出，日本人圈里的小道消息搅得留学生人心不安，如“不赶快回国北京机场就要关闭”，“再晚了回国后要被隔离”等等。
在政府呼吁国民离开北京的同时，一些企业也采取了保护员工措施。5月1日，理光公司指示驻北京的员工到上海工作，近期内公司业务以上海为据点展开。大金公司要求在华常驻的14名员工中除3名负责人留守外其余人员撤回；丰田汽车公司通知其属下驻北京、天津、成都的88名员工及家属黄金周可以回国，机票费用由公司承担，实际上是要求职员回国。
政府对策升级
4月中旬，日本政府就将“非典”指定为“新传染病”。就在日本国民恐惧心理加剧之际，5月1日下午，日本政府召开“非典”问题对策会议，号召近期从疫区回国人员10天之内避免出门，减少走亲访友，将活动范围缩小到最小限度。呼吁他们尽量佩带口罩。同时将国立国际医疗中心确定为特殊传染病定点医疗机构，建立了700多张对外隔绝空气的负压病房，规定一旦发现确诊病人将实行强制隔离，并对可能感染的周围人群进行跟踪检查。政府还向每个都道府县派遣了专家小组。日本专家呼吁仍在海外的日本人遇到传染发生应就地住院治疗，日本外务省宣布一旦在外人员感染，日本将派出医务人员前往国外协助治疗。日本官房副长官表示政府正在研究成立常设的对策本部。
有记者问日本政府是否预感到近期将有确诊患者出现才加强行政对策，对此日本官房副长官未置是否。但日本的周刊杂志《女性自身》报道，专家预测黄金周后“非典”病毒将登陆日本，并可能引起蔓延。
日本尚无感染病例
日本全国上下如此戒备，但至今日本并未确诊“非典”感染病例，几例可疑报告已经让日本心神不安。日本将发烧38度以上伴有呼吸困难、10天内从“非典”疫区归来者定为“疑似病例”，在此基础上通过
X光检查发现肺炎症状者定为“可能病例”，对于可能病例投以3天以上的抗生素治疗不见好转者，通过病毒检查才能确诊为“非典患者”。汇总迄今日本各都道府县向厚生劳动省的报告，共发现疑似病例45人、可能病例16人，但经“非典”专家委员会的核查，40名疑似病例和14名可能病例已经被排除“非典”类别，未被排除人员中疑似病例的4人症状消逝，1人留院观察，另2名可能病例中1人康复出院，另1人因其他疾病住院观察。日本专家指出，到疫区旅游、工作的日本人如此众多，很难想像没有感染，只能解释为感染者很幸运，在症状没有恶化就很快恢复。
即便如此，日本各界还是有备无患，大部分都道府县都指定了“非典”专科治疗医院，并配备了专用救护车，加强了对医护人员的专业培训。一些地方政府也采取了具体的预防“非典”对策措施。如山梨县河口湖地区是富士山旅游的名胜景地，该町规定所有的旅游客房必须配备消毒皂、漱口药等消毒用品，为此町政府拨款500万日元，补助各旅馆此项支出的半额。
