八大高原湖泊治污资金到位率低
审计调查发现，不仅“十一五”规划项目资金到位率低，就是“十五”计划项目也有53330万元没有到位，而且资金使用中存在违规行为：挤占挪用专项资金319.51万元；资金拨付不及时452.05万元；自行改变项目资金计划140万元。
此外，审计还发现，污水处理厂与管网不配套，少数项目设施未能充分发挥效能；垃圾填埋场建设滞后，湖泊流域的生活垃圾对湖泊的污染压力仍然很大，入湖河道的综合整治任务艰巨。“十五”计划安排的永胜程海流域、洱源县、石屏县和阳宗镇垃圾填埋场等4个项目均未实施；面山造林、退耕还林投入不足，各湖泊流域森林覆盖率低，生态效益未能充分体现；少数项目未实行招投标，未及时办理工程项目决算，未及时组织验收和移交，增加了工程项目的成本费用。
这份云南省审计厅发布的2008年第1号审计结果公告中还指出，近期因砷污染引起社会关注的阳宗海，其保护范围的总体规划至今还未编制。造成这一情况的原因主要是阳宗海管理涉及两市三县以及阳宗海管理处，缺乏必要的纽带，没有真正建立统一、协调、高效的监管体制。
公告还指出，水污染综合防治项目涉及部门多，资金来源渠道复杂，省、州市湖泊管理领导小组办公室难以及时了解和掌握项目的实施进度和资金到位使用情况。
据悉，根据云南省审计厅审计调查发现的问题，8大高原湖泊涉及到的州、市政府已经对发现的情况进行了整改，昆明市、玉溪市、丽江市，贗江县、通海县、江川县、宁蒗县已归还挤占挪用资金75.24万元，已有整改措施待落实的192.16万元；已拨付资金132万元，已落实应归还省级九湖专项资金40万元；已归还原项目资金50万元。
记者从云南省环保局获悉，阳宗海流域行政区划调整工作目前正在推进中。云南省环保局副局长杨志强表示，要通过科学区划调整，改变两市三县多头管理阳宗海的状况，使阳宗海能够得到统一规划，统一监管。阳宗海水污染治理已经被列为云南省人民政府今后3年重点督办的事项，昆明市政府和玉溪市政府将建立阳宗海水污染监测、治理情况每日报告制度。