地震发生后，日惹面临着可能发生瘟疫的巨大威胁。

    由于印尼地处热带，气温高达三四十摄氏度，遇难者众多，加上救援进展缓慢，因此印尼和国际卫生机构特别担心遇难者的尸体迅速腐烂后会导致瘟疫的发生和蔓延。为此，日惹地方政府呼吁遇难者的亲朋好友和救援机构加快对尸体的处理，迅速开展对灾区的防疫消毒工作，一定不能让瘟疫暴发。

    另外，印度尼西亚能源与矿业部长警告说，尽管没能断定地震是否导致默拉皮火山活动更频繁，但它仍可能大爆发。印尼能源与矿业部地质处处长戴亚托也忧心忡忡地说：“地震显然会影响默拉皮火山，尤其会对它的岩浆层产生相当大的影响。”

    因此，在日惹地震发生24小时后，印尼政府除了密切关注灾区的救援进展外，更把目光投向距离日惹城仅27公里的默拉皮火山。一旦该火山大规模爆发，而日惹城居民来不及逃避的话，那么造成的死亡人数恐怕不止数千人，可能导致全城遭受灭顶之灾。