在中央部门预算执行审计中，共发现经济犯罪案件线索17起，涉案人员28人，已移送有关部门查处。

    ——铁道部、广电总局等6个部门所属的9个单位采取虚列项目、虚报支出或多报人数等方式套取财政资金1404.54万元。

    ——发展改革委、文化部等25个部门所属的92个单位挪用财政资金和其他专项资金等27.54亿元。具体是：用于归还借款、基本建设及对外投资等26.4亿元，用于发放劳务费、津贴补贴等7327.81万元，用于日常支出4032.61万元。

    ——电监会、劳动保障部等23个部门所属的33个单位采取隐瞒收入、虚列支出等方式转移资金5．91亿元，其中5．45亿元未纳入法定账册，部分用于发放职工奖金福利等。如截至2006年年底，电监会所属中国电力企业联合会资产管理中心管理的对外投资和事业基金1．75亿元，未纳入统一核算；该电力企业联合会还用已作废的财务印鉴先后开设3套账户，2004至2006年截留投资收益及所属单位上缴款等收入3451.63万元，支出3026.38万元，主要用于发放职工奖金补贴。

    ——中科院、水利部等13个部门所属的50个单位对外投资管理不严，转制不规范，少计国有资产和权益等，涉及金额22.84亿元。具体是：5个部门所属的39个单位在转制和对外投资过程中，少计国有资产和权益20.12亿元；4个部门所属的7个单位出借资金、对外投资造成国有资产损失或潜在损失2．29亿元；5个部门所属的5个单位擅自处置、核销或低价出售国有资产4300.05万元。

    ——农业部、国资委等11个部门所属的16个单位违规收费或未严格执行非税收入管理规定，涉及金额2．49亿元。具体是：6个部门所属的8个单位自行设立收费项目或持过期的收费许可证收费7950.72万元；5个部门所属的6个单位未执行“收支两条线”规定，涉及金额1．62亿元；3个部门所属的3个单位未及时上缴非税收入730.99万元。

    ——民航总局、信息产业部等4个部门所属的5个单位存在未经批准和超标准、超概算建设办公楼、培训中心等问题，涉及金额17.39亿元。